Василий Раменский закончил физический факультет МГУ в 1995 году, затем аспирантуру Института молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта РАН. Его кандидатская диссертация была посвящена влиянию аминокислотных замен на структуру и функции белков. Работал в ведущих мировых исследовательских центрах: в Калифорнийском университете в Лос-Анджелесе и в Европейской молекулярно-биологической лаборатории в Гейдельберге, Германия.
Основные научные интересы Василия Раменского: функциональный и клинический эффект вариантов генома человека, разработка и применение вычислительных методов для анализа молекулярных данных, искусственный интеллект в биомедицине.
Он автор более 60 научных публикаций, руководитель исследований, поддержанных грантами российских и международных фондов.